Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPBP07199 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPBP07199 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPBP07199 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPBP07199 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPBP07199 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPBP07199 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPBP07199 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPBP07199 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPBP07199 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPBP07199 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPBP07199 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPBP07199 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPBP07199 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPBP07199 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPBP07199 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPBP07199 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPBP07199 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPBP07199 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPBP07199 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPBP07199 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPBP07199 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPBP07199 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPBP07199 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPBP07199 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPBP07199 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPBP07199 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPBP07199 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPBP07199 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPBP07199 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPBP07199 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPBP07199 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPBP07199 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPBP07199 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPBP07199 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPBP07199 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPBP07199 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPBP07199 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPBP07199 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPBP07199 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPBP07199 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPBP07199 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPBP07199 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPBP07199 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPBP07199 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPBP07199 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPBP07199 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPBP07199 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPBP07199 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPBP07199 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPBP07199 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPBP07199 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPBP07199 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPBP07199 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPBP07199 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPBP07199 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPBP07199 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPBP07199 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPBP07199 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CENPBP07199 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CENPBP07199 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CENPBP07199 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CENPBP07199 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CENPBP07199 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CENPBP07199 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CENPBP07199 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CENPBP07199 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CENPBP07199 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CENPBP07199 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CENPBP07199 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CENPBP07199 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CENPBP07199 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CENPBP07199 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CENPBP07199 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CENPBP07199 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPBP07199 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPBP07199 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPBP07199 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPBP07199 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPBP07199 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPBP07199 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPBP07199 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPBP07199 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPBP07199 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPBP07199 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPBP07199 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPBP07199 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPBP07199 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPBP07199 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPBP07199 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPBP07199 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPBP07199 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPBP07199 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPBP07199 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPBP07199 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPBP07199 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPBP07199 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPBP07199 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPBP07199 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPBP07199 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms