Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms