Protein–RNA interactions for Protein: P01891

HLA-A, HLA class I histocompatibility antigen, A-68 alpha chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-AP01891 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms