Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG7O95352 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG7O95352 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG7O95352 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG7O95352 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG7O95352 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG7O95352 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG7O95352 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG7O95352 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG7O95352 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG7O95352 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG7O95352 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG7O95352 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG7O95352 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG7O95352 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG7O95352 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG7O95352 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG7O95352 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG7O95352 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG7O95352 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG7O95352 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG7O95352 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG7O95352 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG7O95352 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG7O95352 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG7O95352 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG7O95352 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG7O95352 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG7O95352 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG7O95352 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG7O95352 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG7O95352 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG7O95352 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG7O95352 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG7O95352 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG7O95352 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG7O95352 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG7O95352 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG7O95352 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG7O95352 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG7O95352 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG7O95352 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG7O95352 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG7O95352 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG7O95352 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG7O95352 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG7O95352 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG7O95352 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG7O95352 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG7O95352 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG7O95352 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG7O95352 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG7O95352 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG7O95352 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG7O95352 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG7O95352 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG7O95352 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG7O95352 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG7O95352 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG7O95352 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG7O95352 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG7O95352 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG7O95352 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG7O95352 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG7O95352 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG7O95352 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG7O95352 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG7O95352 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG7O95352 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG7O95352 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG7O95352 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG7O95352 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG7O95352 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG7O95352 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG7O95352 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG7O95352 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG7O95352 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG7O95352 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG7O95352 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG7O95352 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG7O95352 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG7O95352 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG7O95352 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG7O95352 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG7O95352 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG7O95352 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG7O95352 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG7O95352 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG7O95352 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG7O95352 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG7O95352 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG7O95352 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG7O95352 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG7O95352 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG7O95352 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG7O95352 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG7O95352 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG7O95352 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG7O95352 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG7O95352 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms