Protein–RNA interactions for Protein: O75923

DYSF, Dysferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,080 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYSFO75923 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DYSFO75923 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DYSFO75923 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DYSFO75923 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DYSFO75923 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DYSFO75923 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DYSFO75923 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DYSFO75923 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DYSFO75923 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DYSFO75923 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DYSFO75923 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DYSFO75923 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DYSFO75923 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DYSFO75923 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DYSFO75923 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DYSFO75923 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DYSFO75923 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DYSFO75923 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DYSFO75923 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DYSFO75923 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DYSFO75923 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DYSFO75923 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DYSFO75923 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DYSFO75923 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DYSFO75923 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DYSFO75923 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DYSFO75923 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DYSFO75923 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DYSFO75923 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DYSFO75923 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DYSFO75923 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DYSFO75923 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DYSFO75923 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DYSFO75923 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DYSFO75923 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DYSFO75923 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DYSFO75923 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DYSFO75923 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DYSFO75923 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DYSFO75923 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DYSFO75923 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DYSFO75923 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DYSFO75923 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DYSFO75923 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DYSFO75923 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DYSFO75923 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DYSFO75923 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
DYSFO75923 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DYSFO75923 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DYSFO75923 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DYSFO75923 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DYSFO75923 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DYSFO75923 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DYSFO75923 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DYSFO75923 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DYSFO75923 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DYSFO75923 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DYSFO75923 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DYSFO75923 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DYSFO75923 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DYSFO75923 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DYSFO75923 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DYSFO75923 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DYSFO75923 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DYSFO75923 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DYSFO75923 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DYSFO75923 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DYSFO75923 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DYSFO75923 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DYSFO75923 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DYSFO75923 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DYSFO75923 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DYSFO75923 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DYSFO75923 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DYSFO75923 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DYSFO75923 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DYSFO75923 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DYSFO75923 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DYSFO75923 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DYSFO75923 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DYSFO75923 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DYSFO75923 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DYSFO75923 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DYSFO75923 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DYSFO75923 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DYSFO75923 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DYSFO75923 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DYSFO75923 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DYSFO75923 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DYSFO75923 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DYSFO75923 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DYSFO75923 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DYSFO75923 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DYSFO75923 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DYSFO75923 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DYSFO75923 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DYSFO75923 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DYSFO75923 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DYSFO75923 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DYSFO75923 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms