Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms