Protein–RNA interactions for Protein: O75146

HIP1R, Huntingtin-interacting protein 1-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1RO75146 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIP1RO75146 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms