Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC36.39■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC36.38■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC36.37■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC36.37■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC36.34■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC36.34■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC36.34■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms