Protein–RNA interactions for Protein: O60613

SELENOF, Selenoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOFO60613 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SELENOFO60613 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms