Protein–RNA interactions for Protein: O60393

NOBOX, Homeobox protein NOBOX, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOBOXO60393 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NOBOXO60393 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NOBOXO60393 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NOBOXO60393 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NOBOXO60393 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NOBOXO60393 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NOBOXO60393 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NOBOXO60393 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NOBOXO60393 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NOBOXO60393 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NOBOXO60393 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NOBOXO60393 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NOBOXO60393 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NOBOXO60393 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NOBOXO60393 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NOBOXO60393 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms