Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms