Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
COCHO43405 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COCHO43405 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COCHO43405 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COCHO43405 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
COCHO43405 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COCHO43405 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COCHO43405 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COCHO43405 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COCHO43405 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COCHO43405 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
COCHO43405 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COCHO43405 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COCHO43405 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COCHO43405 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COCHO43405 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COCHO43405 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COCHO43405 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COCHO43405 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COCHO43405 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
COCHO43405 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COCHO43405 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COCHO43405 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COCHO43405 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COCHO43405 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COCHO43405 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COCHO43405 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
COCHO43405 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COCHO43405 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COCHO43405 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COCHO43405 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COCHO43405 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COCHO43405 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COCHO43405 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COCHO43405 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COCHO43405 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COCHO43405 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COCHO43405 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COCHO43405 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COCHO43405 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COCHO43405 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COCHO43405 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COCHO43405 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COCHO43405 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COCHO43405 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COCHO43405 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COCHO43405 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COCHO43405 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COCHO43405 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COCHO43405 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
COCHO43405 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COCHO43405 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
COCHO43405 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COCHO43405 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COCHO43405 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COCHO43405 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COCHO43405 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COCHO43405 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COCHO43405 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COCHO43405 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COCHO43405 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COCHO43405 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COCHO43405 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COCHO43405 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COCHO43405 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COCHO43405 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COCHO43405 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COCHO43405 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
COCHO43405 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
COCHO43405 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COCHO43405 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COCHO43405 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COCHO43405 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COCHO43405 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COCHO43405 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COCHO43405 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COCHO43405 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COCHO43405 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
COCHO43405 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COCHO43405 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COCHO43405 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
COCHO43405 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COCHO43405 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COCHO43405 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COCHO43405 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COCHO43405 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COCHO43405 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
COCHO43405 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COCHO43405 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COCHO43405 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COCHO43405 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COCHO43405 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COCHO43405 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COCHO43405 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COCHO43405 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COCHO43405 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COCHO43405 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COCHO43405 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COCHO43405 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COCHO43405 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms