Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms