Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CEP290O15078 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CEP290O15078 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CEP290O15078 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CEP290O15078 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CEP290O15078 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CEP290O15078 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CEP290O15078 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CEP290O15078 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CEP290O15078 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CEP290O15078 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CEP290O15078 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CEP290O15078 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CEP290O15078 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CEP290O15078 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CEP290O15078 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CEP290O15078 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CEP290O15078 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CEP290O15078 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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CEP290O15078 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CEP290O15078 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CEP290O15078 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CEP290O15078 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CEP290O15078 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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CEP290O15078 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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CEP290O15078 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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CEP290O15078 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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CEP290O15078 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CEP290O15078 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CEP290O15078 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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CEP290O15078 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CEP290O15078 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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CEP290O15078 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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CEP290O15078 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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CEP290O15078 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CEP290O15078 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CEP290O15078 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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CEP290O15078 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CEP290O15078 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CEP290O15078 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CEP290O15078 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CEP290O15078 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CEP290O15078 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CEP290O15078 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
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CEP290O15078 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CEP290O15078 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CEP290O15078 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CEP290O15078 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CEP290O15078 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CEP290O15078 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CEP290O15078 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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