Protein–RNA interactions for Protein: H3BS89

TMEM178B, Transmembrane protein 178B, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM178BH3BS89 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM178BH3BS89 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms