Protein–RNA interactions for Protein: H3BNL8

C6orf229, Uncharacterized protein C6orf229, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf229H3BNL8 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6orf229H3BNL8 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms