Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPIPA5E9PKD4 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms