Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms