Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms