Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms