Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms