Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GMNCA6NCL1 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GMNCA6NCL1 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms