Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms