Protein–RNA interactions for Protein: U3KQA8

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQA8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
U3KQA8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
U3KQA8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
U3KQA8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
U3KQA8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
U3KQA8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
U3KQA8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
U3KQA8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
U3KQA8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
U3KQA8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
U3KQA8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
U3KQA8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
U3KQA8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
U3KQA8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
U3KQA8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
U3KQA8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
U3KQA8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
U3KQA8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
U3KQA8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
U3KQA8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
U3KQA8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
U3KQA8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
U3KQA8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
U3KQA8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
U3KQA8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
U3KQA8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
U3KQA8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
U3KQA8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
U3KQA8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
U3KQA8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
U3KQA8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
U3KQA8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
U3KQA8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
U3KQA8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
U3KQA8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
U3KQA8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
U3KQA8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
U3KQA8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
U3KQA8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
U3KQA8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
U3KQA8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
U3KQA8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
U3KQA8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
U3KQA8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
U3KQA8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
U3KQA8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
U3KQA8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
U3KQA8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
U3KQA8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
U3KQA8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
U3KQA8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
U3KQA8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
U3KQA8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
U3KQA8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
U3KQA8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
U3KQA8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
U3KQA8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
U3KQA8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
U3KQA8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
U3KQA8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
U3KQA8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
U3KQA8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
U3KQA8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
U3KQA8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
U3KQA8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
U3KQA8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
U3KQA8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
U3KQA8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
U3KQA8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
U3KQA8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
U3KQA8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
U3KQA8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
U3KQA8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
U3KQA8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
U3KQA8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
U3KQA8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
U3KQA8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
U3KQA8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
U3KQA8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
U3KQA8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
U3KQA8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
U3KQA8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
U3KQA8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
U3KQA8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
U3KQA8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
U3KQA8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
U3KQA8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
U3KQA8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
U3KQA8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
U3KQA8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
U3KQA8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
U3KQA8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
U3KQA8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
U3KQA8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
U3KQA8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
U3KQA8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
U3KQA8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
U3KQA8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
U3KQA8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
U3KQA8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms