Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6K1

DNMT3A, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3AQ9Y6K1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNMT3AQ9Y6K1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
DNMT3AQ9Y6K1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNMT3AQ9Y6K1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNMT3AQ9Y6K1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNMT3AQ9Y6K1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNMT3AQ9Y6K1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNMT3AQ9Y6K1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNMT3AQ9Y6K1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNMT3AQ9Y6K1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNMT3AQ9Y6K1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNMT3AQ9Y6K1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNMT3AQ9Y6K1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
DNMT3AQ9Y6K1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNMT3AQ9Y6K1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNMT3AQ9Y6K1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNMT3AQ9Y6K1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNMT3AQ9Y6K1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNMT3AQ9Y6K1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNMT3AQ9Y6K1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
DNMT3AQ9Y6K1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNMT3AQ9Y6K1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNMT3AQ9Y6K1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNMT3AQ9Y6K1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNMT3AQ9Y6K1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNMT3AQ9Y6K1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNMT3AQ9Y6K1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNMT3AQ9Y6K1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
DNMT3AQ9Y6K1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNMT3AQ9Y6K1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNMT3AQ9Y6K1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNMT3AQ9Y6K1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNMT3AQ9Y6K1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNMT3AQ9Y6K1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNMT3AQ9Y6K1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNMT3AQ9Y6K1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNMT3AQ9Y6K1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DNMT3AQ9Y6K1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNMT3AQ9Y6K1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNMT3AQ9Y6K1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNMT3AQ9Y6K1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DNMT3AQ9Y6K1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNMT3AQ9Y6K1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNMT3AQ9Y6K1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNMT3AQ9Y6K1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNMT3AQ9Y6K1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNMT3AQ9Y6K1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
DNMT3AQ9Y6K1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNMT3AQ9Y6K1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNMT3AQ9Y6K1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNMT3AQ9Y6K1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNMT3AQ9Y6K1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNMT3AQ9Y6K1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNMT3AQ9Y6K1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNMT3AQ9Y6K1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNMT3AQ9Y6K1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
DNMT3AQ9Y6K1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNMT3AQ9Y6K1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNMT3AQ9Y6K1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNMT3AQ9Y6K1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNMT3AQ9Y6K1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNMT3AQ9Y6K1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNMT3AQ9Y6K1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNMT3AQ9Y6K1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNMT3AQ9Y6K1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNMT3AQ9Y6K1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNMT3AQ9Y6K1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNMT3AQ9Y6K1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DNMT3AQ9Y6K1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNMT3AQ9Y6K1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNMT3AQ9Y6K1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNMT3AQ9Y6K1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNMT3AQ9Y6K1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNMT3AQ9Y6K1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNMT3AQ9Y6K1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
DNMT3AQ9Y6K1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNMT3AQ9Y6K1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNMT3AQ9Y6K1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNMT3AQ9Y6K1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNMT3AQ9Y6K1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNMT3AQ9Y6K1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNMT3AQ9Y6K1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNMT3AQ9Y6K1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
DNMT3AQ9Y6K1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNMT3AQ9Y6K1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNMT3AQ9Y6K1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNMT3AQ9Y6K1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
DNMT3AQ9Y6K1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNMT3AQ9Y6K1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNMT3AQ9Y6K1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNMT3AQ9Y6K1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNMT3AQ9Y6K1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNMT3AQ9Y6K1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNMT3AQ9Y6K1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNMT3AQ9Y6K1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNMT3AQ9Y6K1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNMT3AQ9Y6K1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNMT3AQ9Y6K1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNMT3AQ9Y6K1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNMT3AQ9Y6K1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms