Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6A4

CFAP20, Cilia- and flagella-associated protein 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP20Q9Y6A4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP20Q9Y6A4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP20Q9Y6A4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP20Q9Y6A4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP20Q9Y6A4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP20Q9Y6A4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP20Q9Y6A4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP20Q9Y6A4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP20Q9Y6A4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP20Q9Y6A4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP20Q9Y6A4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP20Q9Y6A4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP20Q9Y6A4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP20Q9Y6A4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP20Q9Y6A4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP20Q9Y6A4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP20Q9Y6A4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP20Q9Y6A4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP20Q9Y6A4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP20Q9Y6A4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP20Q9Y6A4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP20Q9Y6A4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP20Q9Y6A4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP20Q9Y6A4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP20Q9Y6A4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP20Q9Y6A4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP20Q9Y6A4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP20Q9Y6A4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP20Q9Y6A4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP20Q9Y6A4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP20Q9Y6A4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP20Q9Y6A4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP20Q9Y6A4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP20Q9Y6A4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP20Q9Y6A4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP20Q9Y6A4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP20Q9Y6A4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP20Q9Y6A4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP20Q9Y6A4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP20Q9Y6A4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP20Q9Y6A4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP20Q9Y6A4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP20Q9Y6A4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP20Q9Y6A4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CFAP20Q9Y6A4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFAP20Q9Y6A4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFAP20Q9Y6A4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFAP20Q9Y6A4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP20Q9Y6A4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP20Q9Y6A4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP20Q9Y6A4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP20Q9Y6A4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP20Q9Y6A4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP20Q9Y6A4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP20Q9Y6A4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP20Q9Y6A4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP20Q9Y6A4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP20Q9Y6A4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP20Q9Y6A4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP20Q9Y6A4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP20Q9Y6A4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP20Q9Y6A4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP20Q9Y6A4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP20Q9Y6A4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP20Q9Y6A4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP20Q9Y6A4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP20Q9Y6A4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP20Q9Y6A4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP20Q9Y6A4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP20Q9Y6A4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP20Q9Y6A4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP20Q9Y6A4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP20Q9Y6A4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP20Q9Y6A4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP20Q9Y6A4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP20Q9Y6A4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP20Q9Y6A4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP20Q9Y6A4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP20Q9Y6A4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP20Q9Y6A4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP20Q9Y6A4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP20Q9Y6A4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP20Q9Y6A4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP20Q9Y6A4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP20Q9Y6A4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP20Q9Y6A4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP20Q9Y6A4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP20Q9Y6A4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP20Q9Y6A4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP20Q9Y6A4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP20Q9Y6A4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP20Q9Y6A4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP20Q9Y6A4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP20Q9Y6A4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP20Q9Y6A4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP20Q9Y6A4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP20Q9Y6A4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP20Q9Y6A4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP20Q9Y6A4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP20Q9Y6A4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms