Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX9Q9Y5X1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX9Q9Y5X1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX9Q9Y5X1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX9Q9Y5X1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNX9Q9Y5X1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNX9Q9Y5X1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNX9Q9Y5X1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNX9Q9Y5X1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNX9Q9Y5X1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNX9Q9Y5X1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNX9Q9Y5X1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNX9Q9Y5X1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNX9Q9Y5X1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNX9Q9Y5X1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNX9Q9Y5X1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNX9Q9Y5X1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNX9Q9Y5X1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNX9Q9Y5X1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNX9Q9Y5X1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNX9Q9Y5X1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX9Q9Y5X1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX9Q9Y5X1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX9Q9Y5X1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX9Q9Y5X1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX9Q9Y5X1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX9Q9Y5X1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNX9Q9Y5X1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNX9Q9Y5X1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNX9Q9Y5X1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNX9Q9Y5X1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNX9Q9Y5X1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNX9Q9Y5X1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNX9Q9Y5X1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SNX9Q9Y5X1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNX9Q9Y5X1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNX9Q9Y5X1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX9Q9Y5X1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX9Q9Y5X1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX9Q9Y5X1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX9Q9Y5X1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX9Q9Y5X1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX9Q9Y5X1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX9Q9Y5X1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX9Q9Y5X1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX9Q9Y5X1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX9Q9Y5X1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX9Q9Y5X1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX9Q9Y5X1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX9Q9Y5X1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX9Q9Y5X1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX9Q9Y5X1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX9Q9Y5X1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX9Q9Y5X1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX9Q9Y5X1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNX9Q9Y5X1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNX9Q9Y5X1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SNX9Q9Y5X1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNX9Q9Y5X1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNX9Q9Y5X1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNX9Q9Y5X1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNX9Q9Y5X1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNX9Q9Y5X1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNX9Q9Y5X1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNX9Q9Y5X1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNX9Q9Y5X1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SNX9Q9Y5X1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SNX9Q9Y5X1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNX9Q9Y5X1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNX9Q9Y5X1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNX9Q9Y5X1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNX9Q9Y5X1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNX9Q9Y5X1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNX9Q9Y5X1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SNX9Q9Y5X1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNX9Q9Y5X1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNX9Q9Y5X1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNX9Q9Y5X1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNX9Q9Y5X1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SNX9Q9Y5X1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNX9Q9Y5X1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNX9Q9Y5X1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNX9Q9Y5X1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX9Q9Y5X1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SNX9Q9Y5X1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SNX9Q9Y5X1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SNX9Q9Y5X1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SNX9Q9Y5X1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNX9Q9Y5X1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX9Q9Y5X1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX9Q9Y5X1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX9Q9Y5X1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNX9Q9Y5X1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNX9Q9Y5X1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNX9Q9Y5X1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNX9Q9Y5X1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNX9Q9Y5X1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNX9Q9Y5X1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNX9Q9Y5X1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNX9Q9Y5X1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms