Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P3

RAI2, Retinoic acid-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAI2Q9Y5P3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAI2Q9Y5P3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RAI2Q9Y5P3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAI2Q9Y5P3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAI2Q9Y5P3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAI2Q9Y5P3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAI2Q9Y5P3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAI2Q9Y5P3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAI2Q9Y5P3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAI2Q9Y5P3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAI2Q9Y5P3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAI2Q9Y5P3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAI2Q9Y5P3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAI2Q9Y5P3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAI2Q9Y5P3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAI2Q9Y5P3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAI2Q9Y5P3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAI2Q9Y5P3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAI2Q9Y5P3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAI2Q9Y5P3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAI2Q9Y5P3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAI2Q9Y5P3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAI2Q9Y5P3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAI2Q9Y5P3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAI2Q9Y5P3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAI2Q9Y5P3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAI2Q9Y5P3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAI2Q9Y5P3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAI2Q9Y5P3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAI2Q9Y5P3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAI2Q9Y5P3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAI2Q9Y5P3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAI2Q9Y5P3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAI2Q9Y5P3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAI2Q9Y5P3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAI2Q9Y5P3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAI2Q9Y5P3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAI2Q9Y5P3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAI2Q9Y5P3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAI2Q9Y5P3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RAI2Q9Y5P3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAI2Q9Y5P3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAI2Q9Y5P3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAI2Q9Y5P3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAI2Q9Y5P3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAI2Q9Y5P3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAI2Q9Y5P3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAI2Q9Y5P3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAI2Q9Y5P3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAI2Q9Y5P3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAI2Q9Y5P3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAI2Q9Y5P3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAI2Q9Y5P3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAI2Q9Y5P3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAI2Q9Y5P3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAI2Q9Y5P3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAI2Q9Y5P3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAI2Q9Y5P3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAI2Q9Y5P3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAI2Q9Y5P3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAI2Q9Y5P3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAI2Q9Y5P3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAI2Q9Y5P3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAI2Q9Y5P3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAI2Q9Y5P3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAI2Q9Y5P3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RAI2Q9Y5P3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAI2Q9Y5P3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAI2Q9Y5P3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAI2Q9Y5P3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAI2Q9Y5P3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAI2Q9Y5P3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAI2Q9Y5P3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAI2Q9Y5P3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAI2Q9Y5P3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAI2Q9Y5P3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAI2Q9Y5P3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAI2Q9Y5P3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAI2Q9Y5P3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAI2Q9Y5P3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAI2Q9Y5P3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAI2Q9Y5P3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAI2Q9Y5P3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAI2Q9Y5P3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAI2Q9Y5P3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAI2Q9Y5P3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAI2Q9Y5P3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RAI2Q9Y5P3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAI2Q9Y5P3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAI2Q9Y5P3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAI2Q9Y5P3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAI2Q9Y5P3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAI2Q9Y5P3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RAI2Q9Y5P3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAI2Q9Y5P3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAI2Q9Y5P3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAI2Q9Y5P3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAI2Q9Y5P3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAI2Q9Y5P3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAI2Q9Y5P3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms