Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Q9Y3F1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Q9Y3F1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Q9Y3F1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Q9Y3F1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Q9Y3F1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Q9Y3F1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Q9Y3F1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Q9Y3F1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Q9Y3F1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Q9Y3F1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Q9Y3F1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Q9Y3F1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Q9Y3F1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Q9Y3F1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Q9Y3F1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Q9Y3F1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Q9Y3F1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Q9Y3F1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Q9Y3F1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Q9Y3F1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Q9Y3F1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Q9Y3F1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Q9Y3F1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Q9Y3F1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Q9Y3F1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Q9Y3F1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Q9Y3F1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Q9Y3F1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Q9Y3F1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Q9Y3F1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Q9Y3F1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Q9Y3F1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Q9Y3F1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Q9Y3F1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Q9Y3F1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Q9Y3F1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Q9Y3F1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Q9Y3F1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Q9Y3F1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Q9Y3F1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Q9Y3F1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Q9Y3F1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Q9Y3F1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Q9Y3F1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Q9Y3F1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Q9Y3F1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Q9Y3F1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Q9Y3F1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Q9Y3F1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Q9Y3F1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Q9Y3F1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Q9Y3F1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Q9Y3F1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Q9Y3F1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Q9Y3F1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Q9Y3F1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Q9Y3F1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Q9Y3F1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Q9Y3F1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Q9Y3F1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Q9Y3F1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Q9Y3F1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Q9Y3F1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Q9Y3F1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Q9Y3F1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Q9Y3F1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Q9Y3F1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Q9Y3F1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Q9Y3F1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Q9Y3F1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Q9Y3F1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Q9Y3F1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Q9Y3F1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Q9Y3F1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Q9Y3F1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Q9Y3F1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Q9Y3F1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Q9Y3F1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Q9Y3F1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Q9Y3F1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Q9Y3F1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Q9Y3F1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Q9Y3F1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Q9Y3F1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Q9Y3F1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Q9Y3F1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Q9Y3F1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Q9Y3F1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Q9Y3F1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Q9Y3F1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Q9Y3F1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Q9Y3F1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Q9Y3F1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Q9Y3F1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Q9Y3F1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Q9Y3F1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Q9Y3F1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Q9Y3F1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Q9Y3F1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms