Protein–RNA interactions for Protein: Q9UND3

NPIPA1, Nuclear pore complex-interacting protein family member A1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA1Q9UND3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPIPA1Q9UND3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPIPA1Q9UND3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPIPA1Q9UND3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPIPA1Q9UND3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPIPA1Q9UND3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPIPA1Q9UND3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPIPA1Q9UND3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPIPA1Q9UND3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPIPA1Q9UND3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPIPA1Q9UND3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPIPA1Q9UND3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPIPA1Q9UND3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPIPA1Q9UND3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPIPA1Q9UND3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPIPA1Q9UND3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPIPA1Q9UND3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPIPA1Q9UND3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPIPA1Q9UND3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPIPA1Q9UND3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPIPA1Q9UND3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPIPA1Q9UND3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPIPA1Q9UND3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPIPA1Q9UND3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPIPA1Q9UND3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPIPA1Q9UND3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPIPA1Q9UND3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPIPA1Q9UND3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPIPA1Q9UND3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPIPA1Q9UND3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPIPA1Q9UND3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPIPA1Q9UND3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NPIPA1Q9UND3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPIPA1Q9UND3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NPIPA1Q9UND3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPIPA1Q9UND3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPIPA1Q9UND3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPIPA1Q9UND3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NPIPA1Q9UND3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPIPA1Q9UND3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NPIPA1Q9UND3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPIPA1Q9UND3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPIPA1Q9UND3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPIPA1Q9UND3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPIPA1Q9UND3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPIPA1Q9UND3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPIPA1Q9UND3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPIPA1Q9UND3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPIPA1Q9UND3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPIPA1Q9UND3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPIPA1Q9UND3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPIPA1Q9UND3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPIPA1Q9UND3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPIPA1Q9UND3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPIPA1Q9UND3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPIPA1Q9UND3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPIPA1Q9UND3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPIPA1Q9UND3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPIPA1Q9UND3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NPIPA1Q9UND3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPIPA1Q9UND3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPIPA1Q9UND3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPIPA1Q9UND3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPIPA1Q9UND3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NPIPA1Q9UND3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NPIPA1Q9UND3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NPIPA1Q9UND3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NPIPA1Q9UND3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPIPA1Q9UND3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPIPA1Q9UND3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPIPA1Q9UND3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPIPA1Q9UND3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPIPA1Q9UND3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPIPA1Q9UND3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPIPA1Q9UND3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPIPA1Q9UND3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPIPA1Q9UND3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPIPA1Q9UND3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPIPA1Q9UND3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NPIPA1Q9UND3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPIPA1Q9UND3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPIPA1Q9UND3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPIPA1Q9UND3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPIPA1Q9UND3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPIPA1Q9UND3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPIPA1Q9UND3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPIPA1Q9UND3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPIPA1Q9UND3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPIPA1Q9UND3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NPIPA1Q9UND3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPIPA1Q9UND3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPIPA1Q9UND3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPIPA1Q9UND3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPIPA1Q9UND3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPIPA1Q9UND3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPIPA1Q9UND3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPIPA1Q9UND3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPIPA1Q9UND3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPIPA1Q9UND3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPIPA1Q9UND3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms