Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
MED23Q9ULK4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
MED23Q9ULK4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
MED23Q9ULK4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
MED23Q9ULK4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
MED23Q9ULK4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
MED23Q9ULK4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
MED23Q9ULK4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
MED23Q9ULK4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
MED23Q9ULK4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
MED23Q9ULK4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
MED23Q9ULK4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
MED23Q9ULK4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
MED23Q9ULK4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
MED23Q9ULK4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
MED23Q9ULK4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
MED23Q9ULK4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
MED23Q9ULK4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
MED23Q9ULK4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
MED23Q9ULK4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
MED23Q9ULK4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
MED23Q9ULK4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
MED23Q9ULK4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
MED23Q9ULK4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
MED23Q9ULK4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
MED23Q9ULK4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
MED23Q9ULK4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
MED23Q9ULK4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
MED23Q9ULK4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
MED23Q9ULK4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
MED23Q9ULK4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
MED23Q9ULK4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
MED23Q9ULK4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
MED23Q9ULK4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
MED23Q9ULK4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
MED23Q9ULK4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
MED23Q9ULK4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
MED23Q9ULK4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
MED23Q9ULK4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
MED23Q9ULK4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
MED23Q9ULK4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
MED23Q9ULK4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
MED23Q9ULK4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
MED23Q9ULK4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
MED23Q9ULK4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
MED23Q9ULK4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
MED23Q9ULK4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
MED23Q9ULK4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
MED23Q9ULK4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
MED23Q9ULK4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
MED23Q9ULK4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
MED23Q9ULK4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
MED23Q9ULK4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
MED23Q9ULK4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
MED23Q9ULK4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
MED23Q9ULK4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
MED23Q9ULK4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
MED23Q9ULK4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
MED23Q9ULK4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
MED23Q9ULK4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
MED23Q9ULK4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
MED23Q9ULK4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
MED23Q9ULK4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
MED23Q9ULK4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
MED23Q9ULK4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
MED23Q9ULK4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
MED23Q9ULK4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
MED23Q9ULK4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
MED23Q9ULK4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
MED23Q9ULK4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
MED23Q9ULK4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
MED23Q9ULK4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
MED23Q9ULK4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
MED23Q9ULK4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
MED23Q9ULK4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
MED23Q9ULK4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
MED23Q9ULK4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
MED23Q9ULK4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
MED23Q9ULK4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
MED23Q9ULK4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
MED23Q9ULK4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
MED23Q9ULK4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
MED23Q9ULK4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
MED23Q9ULK4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
MED23Q9ULK4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
MED23Q9ULK4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
MED23Q9ULK4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
MED23Q9ULK4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
MED23Q9ULK4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
MED23Q9ULK4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
MED23Q9ULK4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
MED23Q9ULK4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
MED23Q9ULK4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
MED23Q9ULK4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
MED23Q9ULK4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
MED23Q9ULK4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
MED23Q9ULK4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
MED23Q9ULK4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
MED23Q9ULK4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
MED23Q9ULK4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms