Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MED13Q9UHV7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MED13Q9UHV7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MED13Q9UHV7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MED13Q9UHV7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MED13Q9UHV7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MED13Q9UHV7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MED13Q9UHV7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MED13Q9UHV7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MED13Q9UHV7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MED13Q9UHV7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MED13Q9UHV7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED13Q9UHV7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED13Q9UHV7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED13Q9UHV7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED13Q9UHV7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED13Q9UHV7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED13Q9UHV7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED13Q9UHV7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MED13Q9UHV7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MED13Q9UHV7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MED13Q9UHV7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MED13Q9UHV7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MED13Q9UHV7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED13Q9UHV7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED13Q9UHV7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MED13Q9UHV7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MED13Q9UHV7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED13Q9UHV7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED13Q9UHV7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MED13Q9UHV7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MED13Q9UHV7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MED13Q9UHV7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MED13Q9UHV7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MED13Q9UHV7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MED13Q9UHV7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MED13Q9UHV7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MED13Q9UHV7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MED13Q9UHV7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MED13Q9UHV7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MED13Q9UHV7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MED13Q9UHV7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MED13Q9UHV7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MED13Q9UHV7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MED13Q9UHV7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MED13Q9UHV7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MED13Q9UHV7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MED13Q9UHV7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MED13Q9UHV7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MED13Q9UHV7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MED13Q9UHV7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MED13Q9UHV7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MED13Q9UHV7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED13Q9UHV7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED13Q9UHV7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED13Q9UHV7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MED13Q9UHV7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED13Q9UHV7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED13Q9UHV7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED13Q9UHV7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MED13Q9UHV7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MED13Q9UHV7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MED13Q9UHV7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MED13Q9UHV7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MED13Q9UHV7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MED13Q9UHV7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MED13Q9UHV7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MED13Q9UHV7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MED13Q9UHV7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MED13Q9UHV7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MED13Q9UHV7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MED13Q9UHV7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MED13Q9UHV7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MED13Q9UHV7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MED13Q9UHV7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MED13Q9UHV7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MED13Q9UHV7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MED13Q9UHV7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MED13Q9UHV7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MED13Q9UHV7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MED13Q9UHV7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MED13Q9UHV7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MED13Q9UHV7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MED13Q9UHV7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED13Q9UHV7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED13Q9UHV7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED13Q9UHV7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED13Q9UHV7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED13Q9UHV7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED13Q9UHV7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED13Q9UHV7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED13Q9UHV7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MED13Q9UHV7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MED13Q9UHV7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MED13Q9UHV7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MED13Q9UHV7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
MED13Q9UHV7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MED13Q9UHV7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MED13Q9UHV7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MED13Q9UHV7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms