Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLIP2Q9UDT6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLIP2Q9UDT6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLIP2Q9UDT6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CLIP2Q9UDT6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLIP2Q9UDT6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLIP2Q9UDT6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLIP2Q9UDT6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLIP2Q9UDT6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CLIP2Q9UDT6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLIP2Q9UDT6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLIP2Q9UDT6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLIP2Q9UDT6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
CLIP2Q9UDT6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLIP2Q9UDT6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLIP2Q9UDT6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLIP2Q9UDT6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLIP2Q9UDT6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLIP2Q9UDT6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLIP2Q9UDT6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLIP2Q9UDT6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLIP2Q9UDT6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLIP2Q9UDT6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLIP2Q9UDT6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLIP2Q9UDT6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLIP2Q9UDT6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLIP2Q9UDT6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLIP2Q9UDT6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLIP2Q9UDT6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLIP2Q9UDT6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLIP2Q9UDT6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CLIP2Q9UDT6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CLIP2Q9UDT6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CLIP2Q9UDT6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CLIP2Q9UDT6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CLIP2Q9UDT6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CLIP2Q9UDT6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CLIP2Q9UDT6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CLIP2Q9UDT6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLIP2Q9UDT6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLIP2Q9UDT6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLIP2Q9UDT6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLIP2Q9UDT6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLIP2Q9UDT6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLIP2Q9UDT6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLIP2Q9UDT6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLIP2Q9UDT6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLIP2Q9UDT6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLIP2Q9UDT6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CLIP2Q9UDT6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLIP2Q9UDT6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLIP2Q9UDT6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLIP2Q9UDT6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLIP2Q9UDT6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLIP2Q9UDT6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CLIP2Q9UDT6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLIP2Q9UDT6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CLIP2Q9UDT6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CLIP2Q9UDT6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CLIP2Q9UDT6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CLIP2Q9UDT6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLIP2Q9UDT6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLIP2Q9UDT6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLIP2Q9UDT6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLIP2Q9UDT6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLIP2Q9UDT6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLIP2Q9UDT6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLIP2Q9UDT6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLIP2Q9UDT6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLIP2Q9UDT6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLIP2Q9UDT6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLIP2Q9UDT6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLIP2Q9UDT6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLIP2Q9UDT6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLIP2Q9UDT6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLIP2Q9UDT6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CLIP2Q9UDT6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLIP2Q9UDT6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLIP2Q9UDT6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLIP2Q9UDT6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLIP2Q9UDT6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLIP2Q9UDT6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLIP2Q9UDT6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLIP2Q9UDT6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLIP2Q9UDT6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLIP2Q9UDT6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLIP2Q9UDT6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CLIP2Q9UDT6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLIP2Q9UDT6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLIP2Q9UDT6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLIP2Q9UDT6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLIP2Q9UDT6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLIP2Q9UDT6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLIP2Q9UDT6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CLIP2Q9UDT6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLIP2Q9UDT6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLIP2Q9UDT6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLIP2Q9UDT6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLIP2Q9UDT6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLIP2Q9UDT6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.7 ms