Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM8A1Q9UBU6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM8A1Q9UBU6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM8A1Q9UBU6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM8A1Q9UBU6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM8A1Q9UBU6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM8A1Q9UBU6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM8A1Q9UBU6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM8A1Q9UBU6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM8A1Q9UBU6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM8A1Q9UBU6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM8A1Q9UBU6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM8A1Q9UBU6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM8A1Q9UBU6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM8A1Q9UBU6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM8A1Q9UBU6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM8A1Q9UBU6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM8A1Q9UBU6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM8A1Q9UBU6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM8A1Q9UBU6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM8A1Q9UBU6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM8A1Q9UBU6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM8A1Q9UBU6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM8A1Q9UBU6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM8A1Q9UBU6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM8A1Q9UBU6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM8A1Q9UBU6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM8A1Q9UBU6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM8A1Q9UBU6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM8A1Q9UBU6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM8A1Q9UBU6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM8A1Q9UBU6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM8A1Q9UBU6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM8A1Q9UBU6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM8A1Q9UBU6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM8A1Q9UBU6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM8A1Q9UBU6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM8A1Q9UBU6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM8A1Q9UBU6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM8A1Q9UBU6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM8A1Q9UBU6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM8A1Q9UBU6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM8A1Q9UBU6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM8A1Q9UBU6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM8A1Q9UBU6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM8A1Q9UBU6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM8A1Q9UBU6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM8A1Q9UBU6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM8A1Q9UBU6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM8A1Q9UBU6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM8A1Q9UBU6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM8A1Q9UBU6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM8A1Q9UBU6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM8A1Q9UBU6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM8A1Q9UBU6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM8A1Q9UBU6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM8A1Q9UBU6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM8A1Q9UBU6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM8A1Q9UBU6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM8A1Q9UBU6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FAM8A1Q9UBU6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM8A1Q9UBU6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM8A1Q9UBU6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM8A1Q9UBU6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM8A1Q9UBU6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM8A1Q9UBU6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM8A1Q9UBU6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM8A1Q9UBU6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM8A1Q9UBU6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM8A1Q9UBU6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM8A1Q9UBU6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM8A1Q9UBU6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM8A1Q9UBU6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM8A1Q9UBU6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM8A1Q9UBU6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM8A1Q9UBU6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM8A1Q9UBU6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM8A1Q9UBU6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM8A1Q9UBU6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM8A1Q9UBU6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM8A1Q9UBU6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM8A1Q9UBU6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM8A1Q9UBU6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM8A1Q9UBU6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM8A1Q9UBU6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM8A1Q9UBU6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM8A1Q9UBU6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM8A1Q9UBU6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM8A1Q9UBU6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM8A1Q9UBU6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM8A1Q9UBU6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM8A1Q9UBU6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM8A1Q9UBU6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM8A1Q9UBU6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM8A1Q9UBU6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM8A1Q9UBU6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM8A1Q9UBU6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM8A1Q9UBU6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM8A1Q9UBU6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM8A1Q9UBU6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms