Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HDAC6Q9UBN7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HDAC6Q9UBN7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HDAC6Q9UBN7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HDAC6Q9UBN7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HDAC6Q9UBN7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HDAC6Q9UBN7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HDAC6Q9UBN7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HDAC6Q9UBN7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HDAC6Q9UBN7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HDAC6Q9UBN7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HDAC6Q9UBN7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HDAC6Q9UBN7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HDAC6Q9UBN7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HDAC6Q9UBN7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
HDAC6Q9UBN7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HDAC6Q9UBN7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
HDAC6Q9UBN7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
HDAC6Q9UBN7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HDAC6Q9UBN7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HDAC6Q9UBN7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HDAC6Q9UBN7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HDAC6Q9UBN7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
HDAC6Q9UBN7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HDAC6Q9UBN7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HDAC6Q9UBN7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HDAC6Q9UBN7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
HDAC6Q9UBN7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
HDAC6Q9UBN7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HDAC6Q9UBN7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
HDAC6Q9UBN7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HDAC6Q9UBN7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HDAC6Q9UBN7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HDAC6Q9UBN7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
HDAC6Q9UBN7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HDAC6Q9UBN7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HDAC6Q9UBN7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HDAC6Q9UBN7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HDAC6Q9UBN7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HDAC6Q9UBN7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HDAC6Q9UBN7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HDAC6Q9UBN7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HDAC6Q9UBN7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HDAC6Q9UBN7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
HDAC6Q9UBN7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HDAC6Q9UBN7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HDAC6Q9UBN7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HDAC6Q9UBN7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HDAC6Q9UBN7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HDAC6Q9UBN7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
HDAC6Q9UBN7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HDAC6Q9UBN7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HDAC6Q9UBN7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HDAC6Q9UBN7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HDAC6Q9UBN7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HDAC6Q9UBN7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HDAC6Q9UBN7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HDAC6Q9UBN7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HDAC6Q9UBN7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HDAC6Q9UBN7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HDAC6Q9UBN7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HDAC6Q9UBN7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HDAC6Q9UBN7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HDAC6Q9UBN7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HDAC6Q9UBN7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HDAC6Q9UBN7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HDAC6Q9UBN7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HDAC6Q9UBN7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HDAC6Q9UBN7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HDAC6Q9UBN7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HDAC6Q9UBN7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
HDAC6Q9UBN7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
HDAC6Q9UBN7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HDAC6Q9UBN7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HDAC6Q9UBN7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28■■■□□ 2.07
HDAC6Q9UBN7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HDAC6Q9UBN7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
HDAC6Q9UBN7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
HDAC6Q9UBN7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HDAC6Q9UBN7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
HDAC6Q9UBN7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HDAC6Q9UBN7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HDAC6Q9UBN7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HDAC6Q9UBN7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
HDAC6Q9UBN7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HDAC6Q9UBN7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HDAC6Q9UBN7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
HDAC6Q9UBN7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HDAC6Q9UBN7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
HDAC6Q9UBN7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HDAC6Q9UBN7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HDAC6Q9UBN7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HDAC6Q9UBN7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HDAC6Q9UBN7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HDAC6Q9UBN7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HDAC6Q9UBN7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HDAC6Q9UBN7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HDAC6Q9UBN7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HDAC6Q9UBN7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HDAC6Q9UBN7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms