Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X0

DPM3, Dolichol-phosphate mannosyltransferase subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPM3Q9P2X0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DPM3Q9P2X0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DPM3Q9P2X0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DPM3Q9P2X0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DPM3Q9P2X0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DPM3Q9P2X0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DPM3Q9P2X0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DPM3Q9P2X0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DPM3Q9P2X0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DPM3Q9P2X0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DPM3Q9P2X0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DPM3Q9P2X0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DPM3Q9P2X0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DPM3Q9P2X0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DPM3Q9P2X0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DPM3Q9P2X0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DPM3Q9P2X0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DPM3Q9P2X0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DPM3Q9P2X0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DPM3Q9P2X0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DPM3Q9P2X0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DPM3Q9P2X0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DPM3Q9P2X0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DPM3Q9P2X0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DPM3Q9P2X0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DPM3Q9P2X0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DPM3Q9P2X0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DPM3Q9P2X0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DPM3Q9P2X0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DPM3Q9P2X0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DPM3Q9P2X0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DPM3Q9P2X0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DPM3Q9P2X0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DPM3Q9P2X0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DPM3Q9P2X0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DPM3Q9P2X0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DPM3Q9P2X0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
DPM3Q9P2X0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DPM3Q9P2X0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DPM3Q9P2X0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DPM3Q9P2X0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DPM3Q9P2X0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DPM3Q9P2X0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DPM3Q9P2X0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DPM3Q9P2X0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DPM3Q9P2X0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DPM3Q9P2X0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DPM3Q9P2X0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DPM3Q9P2X0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DPM3Q9P2X0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DPM3Q9P2X0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DPM3Q9P2X0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DPM3Q9P2X0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DPM3Q9P2X0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DPM3Q9P2X0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DPM3Q9P2X0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DPM3Q9P2X0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DPM3Q9P2X0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DPM3Q9P2X0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DPM3Q9P2X0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DPM3Q9P2X0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DPM3Q9P2X0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DPM3Q9P2X0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DPM3Q9P2X0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DPM3Q9P2X0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DPM3Q9P2X0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DPM3Q9P2X0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DPM3Q9P2X0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DPM3Q9P2X0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DPM3Q9P2X0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DPM3Q9P2X0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DPM3Q9P2X0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DPM3Q9P2X0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DPM3Q9P2X0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DPM3Q9P2X0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DPM3Q9P2X0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DPM3Q9P2X0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DPM3Q9P2X0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DPM3Q9P2X0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DPM3Q9P2X0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DPM3Q9P2X0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DPM3Q9P2X0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DPM3Q9P2X0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DPM3Q9P2X0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DPM3Q9P2X0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DPM3Q9P2X0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DPM3Q9P2X0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DPM3Q9P2X0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DPM3Q9P2X0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DPM3Q9P2X0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DPM3Q9P2X0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DPM3Q9P2X0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DPM3Q9P2X0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DPM3Q9P2X0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DPM3Q9P2X0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DPM3Q9P2X0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DPM3Q9P2X0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DPM3Q9P2X0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DPM3Q9P2X0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DPM3Q9P2X0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms