Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PKD2L1Q9P0L9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PKD2L1Q9P0L9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PKD2L1Q9P0L9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PKD2L1Q9P0L9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PKD2L1Q9P0L9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PKD2L1Q9P0L9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PKD2L1Q9P0L9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PKD2L1Q9P0L9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PKD2L1Q9P0L9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PKD2L1Q9P0L9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PKD2L1Q9P0L9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PKD2L1Q9P0L9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PKD2L1Q9P0L9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PKD2L1Q9P0L9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PKD2L1Q9P0L9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PKD2L1Q9P0L9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PKD2L1Q9P0L9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PKD2L1Q9P0L9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PKD2L1Q9P0L9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PKD2L1Q9P0L9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PKD2L1Q9P0L9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PKD2L1Q9P0L9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PKD2L1Q9P0L9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PKD2L1Q9P0L9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PKD2L1Q9P0L9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PKD2L1Q9P0L9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PKD2L1Q9P0L9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PKD2L1Q9P0L9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PKD2L1Q9P0L9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PKD2L1Q9P0L9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PKD2L1Q9P0L9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PKD2L1Q9P0L9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PKD2L1Q9P0L9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PKD2L1Q9P0L9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PKD2L1Q9P0L9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PKD2L1Q9P0L9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PKD2L1Q9P0L9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PKD2L1Q9P0L9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PKD2L1Q9P0L9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PKD2L1Q9P0L9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PKD2L1Q9P0L9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PKD2L1Q9P0L9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PKD2L1Q9P0L9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PKD2L1Q9P0L9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PKD2L1Q9P0L9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PKD2L1Q9P0L9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PKD2L1Q9P0L9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PKD2L1Q9P0L9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PKD2L1Q9P0L9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PKD2L1Q9P0L9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PKD2L1Q9P0L9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PKD2L1Q9P0L9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PKD2L1Q9P0L9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PKD2L1Q9P0L9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PKD2L1Q9P0L9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PKD2L1Q9P0L9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PKD2L1Q9P0L9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PKD2L1Q9P0L9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PKD2L1Q9P0L9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PKD2L1Q9P0L9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PKD2L1Q9P0L9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PKD2L1Q9P0L9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PKD2L1Q9P0L9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PKD2L1Q9P0L9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PKD2L1Q9P0L9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PKD2L1Q9P0L9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PKD2L1Q9P0L9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PKD2L1Q9P0L9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PKD2L1Q9P0L9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PKD2L1Q9P0L9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PKD2L1Q9P0L9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PKD2L1Q9P0L9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PKD2L1Q9P0L9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PKD2L1Q9P0L9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PKD2L1Q9P0L9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PKD2L1Q9P0L9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PKD2L1Q9P0L9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PKD2L1Q9P0L9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PKD2L1Q9P0L9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PKD2L1Q9P0L9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PKD2L1Q9P0L9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PKD2L1Q9P0L9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PKD2L1Q9P0L9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PKD2L1Q9P0L9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PKD2L1Q9P0L9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PKD2L1Q9P0L9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PKD2L1Q9P0L9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PKD2L1Q9P0L9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PKD2L1Q9P0L9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PKD2L1Q9P0L9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PKD2L1Q9P0L9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PKD2L1Q9P0L9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PKD2L1Q9P0L9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PKD2L1Q9P0L9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PKD2L1Q9P0L9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PKD2L1Q9P0L9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PKD2L1Q9P0L9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PKD2L1Q9P0L9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PKD2L1Q9P0L9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms