Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWS1

PARPBP, PCNA-interacting partner, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARPBPQ9NWS1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PARPBPQ9NWS1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARPBPQ9NWS1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARPBPQ9NWS1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARPBPQ9NWS1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARPBPQ9NWS1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARPBPQ9NWS1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARPBPQ9NWS1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARPBPQ9NWS1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARPBPQ9NWS1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARPBPQ9NWS1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARPBPQ9NWS1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARPBPQ9NWS1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARPBPQ9NWS1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARPBPQ9NWS1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARPBPQ9NWS1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARPBPQ9NWS1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARPBPQ9NWS1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARPBPQ9NWS1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARPBPQ9NWS1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PARPBPQ9NWS1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARPBPQ9NWS1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARPBPQ9NWS1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARPBPQ9NWS1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARPBPQ9NWS1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PARPBPQ9NWS1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARPBPQ9NWS1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARPBPQ9NWS1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARPBPQ9NWS1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARPBPQ9NWS1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARPBPQ9NWS1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PARPBPQ9NWS1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARPBPQ9NWS1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARPBPQ9NWS1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARPBPQ9NWS1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARPBPQ9NWS1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARPBPQ9NWS1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARPBPQ9NWS1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARPBPQ9NWS1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARPBPQ9NWS1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARPBPQ9NWS1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARPBPQ9NWS1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARPBPQ9NWS1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARPBPQ9NWS1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PARPBPQ9NWS1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PARPBPQ9NWS1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PARPBPQ9NWS1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PARPBPQ9NWS1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PARPBPQ9NWS1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARPBPQ9NWS1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARPBPQ9NWS1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARPBPQ9NWS1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARPBPQ9NWS1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARPBPQ9NWS1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARPBPQ9NWS1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARPBPQ9NWS1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARPBPQ9NWS1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARPBPQ9NWS1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARPBPQ9NWS1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARPBPQ9NWS1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARPBPQ9NWS1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARPBPQ9NWS1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARPBPQ9NWS1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARPBPQ9NWS1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARPBPQ9NWS1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARPBPQ9NWS1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARPBPQ9NWS1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARPBPQ9NWS1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARPBPQ9NWS1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARPBPQ9NWS1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PARPBPQ9NWS1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PARPBPQ9NWS1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PARPBPQ9NWS1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARPBPQ9NWS1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARPBPQ9NWS1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARPBPQ9NWS1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARPBPQ9NWS1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARPBPQ9NWS1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARPBPQ9NWS1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARPBPQ9NWS1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARPBPQ9NWS1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARPBPQ9NWS1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARPBPQ9NWS1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARPBPQ9NWS1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARPBPQ9NWS1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARPBPQ9NWS1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARPBPQ9NWS1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARPBPQ9NWS1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARPBPQ9NWS1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARPBPQ9NWS1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARPBPQ9NWS1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PARPBPQ9NWS1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARPBPQ9NWS1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PARPBPQ9NWS1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PARPBPQ9NWS1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARPBPQ9NWS1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARPBPQ9NWS1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PARPBPQ9NWS1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARPBPQ9NWS1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARPBPQ9NWS1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms