Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ASF1BQ9NVP2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ASF1BQ9NVP2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ASF1BQ9NVP2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ASF1BQ9NVP2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ASF1BQ9NVP2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ASF1BQ9NVP2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ASF1BQ9NVP2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASF1BQ9NVP2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASF1BQ9NVP2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASF1BQ9NVP2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASF1BQ9NVP2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ASF1BQ9NVP2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASF1BQ9NVP2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASF1BQ9NVP2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASF1BQ9NVP2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASF1BQ9NVP2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ASF1BQ9NVP2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASF1BQ9NVP2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ASF1BQ9NVP2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ASF1BQ9NVP2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ASF1BQ9NVP2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ASF1BQ9NVP2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ASF1BQ9NVP2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ASF1BQ9NVP2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ASF1BQ9NVP2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASF1BQ9NVP2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASF1BQ9NVP2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASF1BQ9NVP2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ASF1BQ9NVP2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ASF1BQ9NVP2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ASF1BQ9NVP2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ASF1BQ9NVP2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ASF1BQ9NVP2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASF1BQ9NVP2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASF1BQ9NVP2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASF1BQ9NVP2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASF1BQ9NVP2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASF1BQ9NVP2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASF1BQ9NVP2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASF1BQ9NVP2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASF1BQ9NVP2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ASF1BQ9NVP2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASF1BQ9NVP2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASF1BQ9NVP2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASF1BQ9NVP2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASF1BQ9NVP2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASF1BQ9NVP2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASF1BQ9NVP2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASF1BQ9NVP2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASF1BQ9NVP2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASF1BQ9NVP2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ASF1BQ9NVP2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASF1BQ9NVP2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASF1BQ9NVP2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASF1BQ9NVP2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASF1BQ9NVP2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASF1BQ9NVP2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASF1BQ9NVP2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASF1BQ9NVP2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASF1BQ9NVP2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASF1BQ9NVP2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASF1BQ9NVP2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASF1BQ9NVP2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ASF1BQ9NVP2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASF1BQ9NVP2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASF1BQ9NVP2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASF1BQ9NVP2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASF1BQ9NVP2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ASF1BQ9NVP2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASF1BQ9NVP2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASF1BQ9NVP2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASF1BQ9NVP2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASF1BQ9NVP2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASF1BQ9NVP2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASF1BQ9NVP2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ASF1BQ9NVP2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASF1BQ9NVP2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASF1BQ9NVP2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASF1BQ9NVP2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASF1BQ9NVP2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASF1BQ9NVP2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASF1BQ9NVP2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASF1BQ9NVP2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASF1BQ9NVP2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASF1BQ9NVP2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASF1BQ9NVP2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASF1BQ9NVP2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASF1BQ9NVP2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASF1BQ9NVP2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASF1BQ9NVP2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASF1BQ9NVP2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASF1BQ9NVP2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ASF1BQ9NVP2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASF1BQ9NVP2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASF1BQ9NVP2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASF1BQ9NVP2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASF1BQ9NVP2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASF1BQ9NVP2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASF1BQ9NVP2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.3 ms