Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVH0

EXD2, Exonuclease 3'-5' domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXD2Q9NVH0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXD2Q9NVH0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXD2Q9NVH0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXD2Q9NVH0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EXD2Q9NVH0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EXD2Q9NVH0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EXD2Q9NVH0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EXD2Q9NVH0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EXD2Q9NVH0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXD2Q9NVH0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXD2Q9NVH0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXD2Q9NVH0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXD2Q9NVH0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXD2Q9NVH0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXD2Q9NVH0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXD2Q9NVH0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXD2Q9NVH0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXD2Q9NVH0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXD2Q9NVH0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXD2Q9NVH0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXD2Q9NVH0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXD2Q9NVH0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXD2Q9NVH0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXD2Q9NVH0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXD2Q9NVH0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXD2Q9NVH0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXD2Q9NVH0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EXD2Q9NVH0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXD2Q9NVH0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXD2Q9NVH0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXD2Q9NVH0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EXD2Q9NVH0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EXD2Q9NVH0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EXD2Q9NVH0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EXD2Q9NVH0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EXD2Q9NVH0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EXD2Q9NVH0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EXD2Q9NVH0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXD2Q9NVH0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXD2Q9NVH0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXD2Q9NVH0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXD2Q9NVH0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXD2Q9NVH0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXD2Q9NVH0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXD2Q9NVH0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXD2Q9NVH0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXD2Q9NVH0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXD2Q9NVH0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXD2Q9NVH0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXD2Q9NVH0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXD2Q9NVH0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXD2Q9NVH0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXD2Q9NVH0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXD2Q9NVH0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXD2Q9NVH0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXD2Q9NVH0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXD2Q9NVH0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXD2Q9NVH0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXD2Q9NVH0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EXD2Q9NVH0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EXD2Q9NVH0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EXD2Q9NVH0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EXD2Q9NVH0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EXD2Q9NVH0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EXD2Q9NVH0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EXD2Q9NVH0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EXD2Q9NVH0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXD2Q9NVH0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXD2Q9NVH0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXD2Q9NVH0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXD2Q9NVH0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXD2Q9NVH0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXD2Q9NVH0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXD2Q9NVH0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXD2Q9NVH0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXD2Q9NVH0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXD2Q9NVH0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXD2Q9NVH0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXD2Q9NVH0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXD2Q9NVH0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXD2Q9NVH0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXD2Q9NVH0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXD2Q9NVH0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXD2Q9NVH0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
EXD2Q9NVH0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXD2Q9NVH0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXD2Q9NVH0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXD2Q9NVH0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXD2Q9NVH0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXD2Q9NVH0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXD2Q9NVH0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXD2Q9NVH0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXD2Q9NVH0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXD2Q9NVH0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EXD2Q9NVH0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXD2Q9NVH0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXD2Q9NVH0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXD2Q9NVH0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXD2Q9NVH0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXD2Q9NVH0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms