Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ7

UFSP2, Ufm1-specific protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP2Q9NUQ7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.31■■□□□ 1
UFSP2Q9NUQ7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UFSP2Q9NUQ7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UFSP2Q9NUQ7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UFSP2Q9NUQ7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UFSP2Q9NUQ7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UFSP2Q9NUQ7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UFSP2Q9NUQ7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.3■■□□□ 1
UFSP2Q9NUQ7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
UFSP2Q9NUQ7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UFSP2Q9NUQ7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UFSP2Q9NUQ7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UFSP2Q9NUQ7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UFSP2Q9NUQ7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UFSP2Q9NUQ7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UFSP2Q9NUQ7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
UFSP2Q9NUQ7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UFSP2Q9NUQ7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UFSP2Q9NUQ7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UFSP2Q9NUQ7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UFSP2Q9NUQ7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UFSP2Q9NUQ7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UFSP2Q9NUQ7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UFSP2Q9NUQ7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UFSP2Q9NUQ7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UFSP2Q9NUQ7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UFSP2Q9NUQ7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
UFSP2Q9NUQ7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UFSP2Q9NUQ7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UFSP2Q9NUQ7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UFSP2Q9NUQ7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UFSP2Q9NUQ7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UFSP2Q9NUQ7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UFSP2Q9NUQ7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UFSP2Q9NUQ7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UFSP2Q9NUQ7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UFSP2Q9NUQ7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UFSP2Q9NUQ7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UFSP2Q9NUQ7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UFSP2Q9NUQ7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UFSP2Q9NUQ7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UFSP2Q9NUQ7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UFSP2Q9NUQ7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UFSP2Q9NUQ7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UFSP2Q9NUQ7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UFSP2Q9NUQ7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UFSP2Q9NUQ7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
UFSP2Q9NUQ7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UFSP2Q9NUQ7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UFSP2Q9NUQ7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UFSP2Q9NUQ7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UFSP2Q9NUQ7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UFSP2Q9NUQ7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UFSP2Q9NUQ7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UFSP2Q9NUQ7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UFSP2Q9NUQ7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
UFSP2Q9NUQ7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UFSP2Q9NUQ7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UFSP2Q9NUQ7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UFSP2Q9NUQ7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UFSP2Q9NUQ7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UFSP2Q9NUQ7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UFSP2Q9NUQ7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UFSP2Q9NUQ7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UFSP2Q9NUQ7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UFSP2Q9NUQ7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UFSP2Q9NUQ7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UFSP2Q9NUQ7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UFSP2Q9NUQ7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UFSP2Q9NUQ7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UFSP2Q9NUQ7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UFSP2Q9NUQ7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
UFSP2Q9NUQ7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UFSP2Q9NUQ7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UFSP2Q9NUQ7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UFSP2Q9NUQ7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UFSP2Q9NUQ7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
UFSP2Q9NUQ7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
UFSP2Q9NUQ7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
UFSP2Q9NUQ7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
UFSP2Q9NUQ7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UFSP2Q9NUQ7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UFSP2Q9NUQ7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UFSP2Q9NUQ7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UFSP2Q9NUQ7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UFSP2Q9NUQ7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UFSP2Q9NUQ7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UFSP2Q9NUQ7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UFSP2Q9NUQ7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UFSP2Q9NUQ7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UFSP2Q9NUQ7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UFSP2Q9NUQ7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UFSP2Q9NUQ7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UFSP2Q9NUQ7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UFSP2Q9NUQ7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UFSP2Q9NUQ7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UFSP2Q9NUQ7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UFSP2Q9NUQ7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UFSP2Q9NUQ7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UFSP2Q9NUQ7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms