Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN7

ACER3, Alkaline ceramidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3Q9NUN7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACER3Q9NUN7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACER3Q9NUN7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACER3Q9NUN7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACER3Q9NUN7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACER3Q9NUN7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACER3Q9NUN7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACER3Q9NUN7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACER3Q9NUN7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACER3Q9NUN7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACER3Q9NUN7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACER3Q9NUN7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACER3Q9NUN7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ACER3Q9NUN7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACER3Q9NUN7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACER3Q9NUN7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACER3Q9NUN7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACER3Q9NUN7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACER3Q9NUN7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACER3Q9NUN7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACER3Q9NUN7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACER3Q9NUN7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACER3Q9NUN7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ACER3Q9NUN7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACER3Q9NUN7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACER3Q9NUN7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACER3Q9NUN7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ACER3Q9NUN7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACER3Q9NUN7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACER3Q9NUN7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACER3Q9NUN7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACER3Q9NUN7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACER3Q9NUN7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACER3Q9NUN7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACER3Q9NUN7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACER3Q9NUN7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACER3Q9NUN7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACER3Q9NUN7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACER3Q9NUN7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACER3Q9NUN7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACER3Q9NUN7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACER3Q9NUN7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACER3Q9NUN7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACER3Q9NUN7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACER3Q9NUN7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACER3Q9NUN7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACER3Q9NUN7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACER3Q9NUN7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACER3Q9NUN7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACER3Q9NUN7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACER3Q9NUN7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACER3Q9NUN7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACER3Q9NUN7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACER3Q9NUN7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACER3Q9NUN7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACER3Q9NUN7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ACER3Q9NUN7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACER3Q9NUN7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACER3Q9NUN7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACER3Q9NUN7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACER3Q9NUN7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACER3Q9NUN7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ACER3Q9NUN7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ACER3Q9NUN7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ACER3Q9NUN7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACER3Q9NUN7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
ACER3Q9NUN7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ACER3Q9NUN7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACER3Q9NUN7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACER3Q9NUN7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACER3Q9NUN7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACER3Q9NUN7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACER3Q9NUN7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACER3Q9NUN7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ACER3Q9NUN7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ACER3Q9NUN7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ACER3Q9NUN7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ACER3Q9NUN7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ACER3Q9NUN7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ACER3Q9NUN7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ACER3Q9NUN7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ACER3Q9NUN7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ACER3Q9NUN7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ACER3Q9NUN7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACER3Q9NUN7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ACER3Q9NUN7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACER3Q9NUN7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACER3Q9NUN7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACER3Q9NUN7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACER3Q9NUN7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACER3Q9NUN7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACER3Q9NUN7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACER3Q9NUN7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACER3Q9NUN7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACER3Q9NUN7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACER3Q9NUN7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACER3Q9NUN7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACER3Q9NUN7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACER3Q9NUN7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACER3Q9NUN7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
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