Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SAMSN1Q9NSI8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SAMSN1Q9NSI8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SAMSN1Q9NSI8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SAMSN1Q9NSI8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SAMSN1Q9NSI8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SAMSN1Q9NSI8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SAMSN1Q9NSI8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SAMSN1Q9NSI8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SAMSN1Q9NSI8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SAMSN1Q9NSI8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SAMSN1Q9NSI8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SAMSN1Q9NSI8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SAMSN1Q9NSI8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SAMSN1Q9NSI8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SAMSN1Q9NSI8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SAMSN1Q9NSI8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SAMSN1Q9NSI8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SAMSN1Q9NSI8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SAMSN1Q9NSI8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SAMSN1Q9NSI8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SAMSN1Q9NSI8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SAMSN1Q9NSI8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SAMSN1Q9NSI8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SAMSN1Q9NSI8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SAMSN1Q9NSI8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SAMSN1Q9NSI8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SAMSN1Q9NSI8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SAMSN1Q9NSI8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SAMSN1Q9NSI8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SAMSN1Q9NSI8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SAMSN1Q9NSI8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SAMSN1Q9NSI8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SAMSN1Q9NSI8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SAMSN1Q9NSI8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SAMSN1Q9NSI8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SAMSN1Q9NSI8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SAMSN1Q9NSI8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SAMSN1Q9NSI8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SAMSN1Q9NSI8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SAMSN1Q9NSI8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SAMSN1Q9NSI8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SAMSN1Q9NSI8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SAMSN1Q9NSI8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SAMSN1Q9NSI8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SAMSN1Q9NSI8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SAMSN1Q9NSI8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SAMSN1Q9NSI8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SAMSN1Q9NSI8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SAMSN1Q9NSI8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SAMSN1Q9NSI8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SAMSN1Q9NSI8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SAMSN1Q9NSI8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SAMSN1Q9NSI8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SAMSN1Q9NSI8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SAMSN1Q9NSI8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SAMSN1Q9NSI8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SAMSN1Q9NSI8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SAMSN1Q9NSI8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SAMSN1Q9NSI8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SAMSN1Q9NSI8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SAMSN1Q9NSI8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SAMSN1Q9NSI8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SAMSN1Q9NSI8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SAMSN1Q9NSI8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SAMSN1Q9NSI8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SAMSN1Q9NSI8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SAMSN1Q9NSI8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SAMSN1Q9NSI8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SAMSN1Q9NSI8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SAMSN1Q9NSI8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SAMSN1Q9NSI8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SAMSN1Q9NSI8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SAMSN1Q9NSI8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SAMSN1Q9NSI8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SAMSN1Q9NSI8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SAMSN1Q9NSI8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SAMSN1Q9NSI8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SAMSN1Q9NSI8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SAMSN1Q9NSI8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SAMSN1Q9NSI8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SAMSN1Q9NSI8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SAMSN1Q9NSI8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SAMSN1Q9NSI8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SAMSN1Q9NSI8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SAMSN1Q9NSI8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SAMSN1Q9NSI8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SAMSN1Q9NSI8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SAMSN1Q9NSI8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SAMSN1Q9NSI8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SAMSN1Q9NSI8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SAMSN1Q9NSI8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SAMSN1Q9NSI8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SAMSN1Q9NSI8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SAMSN1Q9NSI8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SAMSN1Q9NSI8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SAMSN1Q9NSI8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SAMSN1Q9NSI8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SAMSN1Q9NSI8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SAMSN1Q9NSI8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms