Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS91

RAD18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD18Q9NS91 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAD18Q9NS91 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAD18Q9NS91 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD18Q9NS91 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD18Q9NS91 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD18Q9NS91 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD18Q9NS91 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD18Q9NS91 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD18Q9NS91 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD18Q9NS91 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD18Q9NS91 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD18Q9NS91 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD18Q9NS91 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD18Q9NS91 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD18Q9NS91 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD18Q9NS91 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD18Q9NS91 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAD18Q9NS91 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAD18Q9NS91 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAD18Q9NS91 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAD18Q9NS91 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAD18Q9NS91 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAD18Q9NS91 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAD18Q9NS91 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAD18Q9NS91 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAD18Q9NS91 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAD18Q9NS91 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAD18Q9NS91 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD18Q9NS91 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD18Q9NS91 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD18Q9NS91 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD18Q9NS91 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD18Q9NS91 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD18Q9NS91 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD18Q9NS91 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD18Q9NS91 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD18Q9NS91 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD18Q9NS91 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD18Q9NS91 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAD18Q9NS91 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAD18Q9NS91 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAD18Q9NS91 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAD18Q9NS91 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAD18Q9NS91 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAD18Q9NS91 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RAD18Q9NS91 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD18Q9NS91 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD18Q9NS91 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD18Q9NS91 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD18Q9NS91 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD18Q9NS91 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD18Q9NS91 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD18Q9NS91 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD18Q9NS91 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD18Q9NS91 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD18Q9NS91 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD18Q9NS91 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD18Q9NS91 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD18Q9NS91 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD18Q9NS91 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD18Q9NS91 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAD18Q9NS91 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAD18Q9NS91 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAD18Q9NS91 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAD18Q9NS91 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAD18Q9NS91 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAD18Q9NS91 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RAD18Q9NS91 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAD18Q9NS91 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAD18Q9NS91 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD18Q9NS91 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD18Q9NS91 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD18Q9NS91 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD18Q9NS91 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD18Q9NS91 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD18Q9NS91 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD18Q9NS91 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD18Q9NS91 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD18Q9NS91 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD18Q9NS91 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD18Q9NS91 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD18Q9NS91 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAD18Q9NS91 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAD18Q9NS91 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAD18Q9NS91 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RAD18Q9NS91 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAD18Q9NS91 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD18Q9NS91 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD18Q9NS91 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD18Q9NS91 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD18Q9NS91 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD18Q9NS91 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD18Q9NS91 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAD18Q9NS91 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAD18Q9NS91 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAD18Q9NS91 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RAD18Q9NS91 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAD18Q9NS91 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAD18Q9NS91 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAD18Q9NS91 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms