Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR23

GDF3, Growth/differentiation factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF3Q9NR23 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GDF3Q9NR23 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GDF3Q9NR23 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GDF3Q9NR23 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GDF3Q9NR23 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GDF3Q9NR23 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GDF3Q9NR23 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
GDF3Q9NR23 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GDF3Q9NR23 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GDF3Q9NR23 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
GDF3Q9NR23 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GDF3Q9NR23 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GDF3Q9NR23 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GDF3Q9NR23 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GDF3Q9NR23 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GDF3Q9NR23 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
GDF3Q9NR23 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
GDF3Q9NR23 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
GDF3Q9NR23 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GDF3Q9NR23 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GDF3Q9NR23 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GDF3Q9NR23 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GDF3Q9NR23 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GDF3Q9NR23 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GDF3Q9NR23 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GDF3Q9NR23 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GDF3Q9NR23 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GDF3Q9NR23 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GDF3Q9NR23 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GDF3Q9NR23 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GDF3Q9NR23 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
GDF3Q9NR23 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
GDF3Q9NR23 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
GDF3Q9NR23 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
GDF3Q9NR23 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
GDF3Q9NR23 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
GDF3Q9NR23 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GDF3Q9NR23 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GDF3Q9NR23 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GDF3Q9NR23 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GDF3Q9NR23 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GDF3Q9NR23 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GDF3Q9NR23 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GDF3Q9NR23 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GDF3Q9NR23 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GDF3Q9NR23 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GDF3Q9NR23 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GDF3Q9NR23 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GDF3Q9NR23 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GDF3Q9NR23 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GDF3Q9NR23 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GDF3Q9NR23 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GDF3Q9NR23 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GDF3Q9NR23 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GDF3Q9NR23 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GDF3Q9NR23 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GDF3Q9NR23 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GDF3Q9NR23 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GDF3Q9NR23 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GDF3Q9NR23 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GDF3Q9NR23 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GDF3Q9NR23 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GDF3Q9NR23 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GDF3Q9NR23 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GDF3Q9NR23 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GDF3Q9NR23 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GDF3Q9NR23 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GDF3Q9NR23 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GDF3Q9NR23 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GDF3Q9NR23 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GDF3Q9NR23 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GDF3Q9NR23 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GDF3Q9NR23 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GDF3Q9NR23 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GDF3Q9NR23 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GDF3Q9NR23 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GDF3Q9NR23 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
GDF3Q9NR23 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GDF3Q9NR23 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GDF3Q9NR23 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GDF3Q9NR23 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GDF3Q9NR23 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GDF3Q9NR23 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GDF3Q9NR23 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GDF3Q9NR23 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GDF3Q9NR23 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GDF3Q9NR23 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GDF3Q9NR23 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GDF3Q9NR23 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GDF3Q9NR23 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GDF3Q9NR23 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GDF3Q9NR23 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GDF3Q9NR23 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GDF3Q9NR23 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GDF3Q9NR23 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GDF3Q9NR23 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GDF3Q9NR23 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GDF3Q9NR23 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GDF3Q9NR23 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GDF3Q9NR23 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms