Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
INCENPQ9NQS7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
INCENPQ9NQS7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
INCENPQ9NQS7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
INCENPQ9NQS7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
INCENPQ9NQS7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
INCENPQ9NQS7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
INCENPQ9NQS7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
INCENPQ9NQS7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
INCENPQ9NQS7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
INCENPQ9NQS7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
INCENPQ9NQS7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
INCENPQ9NQS7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
INCENPQ9NQS7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
INCENPQ9NQS7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
INCENPQ9NQS7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
INCENPQ9NQS7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
INCENPQ9NQS7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
INCENPQ9NQS7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
INCENPQ9NQS7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
INCENPQ9NQS7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
INCENPQ9NQS7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
INCENPQ9NQS7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
INCENPQ9NQS7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
INCENPQ9NQS7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
INCENPQ9NQS7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
INCENPQ9NQS7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
INCENPQ9NQS7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
INCENPQ9NQS7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
INCENPQ9NQS7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
INCENPQ9NQS7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
INCENPQ9NQS7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
INCENPQ9NQS7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
INCENPQ9NQS7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
INCENPQ9NQS7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
INCENPQ9NQS7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
INCENPQ9NQS7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
INCENPQ9NQS7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
INCENPQ9NQS7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
INCENPQ9NQS7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
INCENPQ9NQS7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
INCENPQ9NQS7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
INCENPQ9NQS7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
INCENPQ9NQS7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
INCENPQ9NQS7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
INCENPQ9NQS7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
INCENPQ9NQS7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
INCENPQ9NQS7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
INCENPQ9NQS7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
INCENPQ9NQS7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
INCENPQ9NQS7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
INCENPQ9NQS7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
INCENPQ9NQS7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
INCENPQ9NQS7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
INCENPQ9NQS7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
INCENPQ9NQS7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
INCENPQ9NQS7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
INCENPQ9NQS7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
INCENPQ9NQS7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
INCENPQ9NQS7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
INCENPQ9NQS7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
INCENPQ9NQS7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
INCENPQ9NQS7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
INCENPQ9NQS7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
INCENPQ9NQS7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
INCENPQ9NQS7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
INCENPQ9NQS7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
INCENPQ9NQS7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
INCENPQ9NQS7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
INCENPQ9NQS7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
INCENPQ9NQS7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
INCENPQ9NQS7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
INCENPQ9NQS7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
INCENPQ9NQS7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
INCENPQ9NQS7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
INCENPQ9NQS7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
INCENPQ9NQS7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
INCENPQ9NQS7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
INCENPQ9NQS7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
INCENPQ9NQS7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
INCENPQ9NQS7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
INCENPQ9NQS7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
INCENPQ9NQS7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
INCENPQ9NQS7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
INCENPQ9NQS7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
INCENPQ9NQS7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
INCENPQ9NQS7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
INCENPQ9NQS7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
INCENPQ9NQS7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
INCENPQ9NQS7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
INCENPQ9NQS7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
INCENPQ9NQS7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
INCENPQ9NQS7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
INCENPQ9NQS7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
INCENPQ9NQS7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
INCENPQ9NQS7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
INCENPQ9NQS7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
INCENPQ9NQS7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
INCENPQ9NQS7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
INCENPQ9NQS7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms