Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPJ6

MED4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED4Q9NPJ6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MED4Q9NPJ6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MED4Q9NPJ6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MED4Q9NPJ6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MED4Q9NPJ6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MED4Q9NPJ6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MED4Q9NPJ6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MED4Q9NPJ6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MED4Q9NPJ6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MED4Q9NPJ6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MED4Q9NPJ6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MED4Q9NPJ6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MED4Q9NPJ6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MED4Q9NPJ6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MED4Q9NPJ6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MED4Q9NPJ6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MED4Q9NPJ6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MED4Q9NPJ6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MED4Q9NPJ6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MED4Q9NPJ6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MED4Q9NPJ6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MED4Q9NPJ6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MED4Q9NPJ6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MED4Q9NPJ6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MED4Q9NPJ6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MED4Q9NPJ6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MED4Q9NPJ6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MED4Q9NPJ6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MED4Q9NPJ6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MED4Q9NPJ6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MED4Q9NPJ6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MED4Q9NPJ6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MED4Q9NPJ6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MED4Q9NPJ6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MED4Q9NPJ6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MED4Q9NPJ6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MED4Q9NPJ6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MED4Q9NPJ6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MED4Q9NPJ6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MED4Q9NPJ6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MED4Q9NPJ6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MED4Q9NPJ6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
MED4Q9NPJ6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MED4Q9NPJ6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MED4Q9NPJ6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MED4Q9NPJ6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MED4Q9NPJ6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MED4Q9NPJ6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MED4Q9NPJ6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MED4Q9NPJ6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MED4Q9NPJ6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MED4Q9NPJ6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MED4Q9NPJ6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MED4Q9NPJ6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MED4Q9NPJ6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MED4Q9NPJ6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MED4Q9NPJ6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MED4Q9NPJ6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MED4Q9NPJ6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MED4Q9NPJ6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MED4Q9NPJ6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
MED4Q9NPJ6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MED4Q9NPJ6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MED4Q9NPJ6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MED4Q9NPJ6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MED4Q9NPJ6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MED4Q9NPJ6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MED4Q9NPJ6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MED4Q9NPJ6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MED4Q9NPJ6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MED4Q9NPJ6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MED4Q9NPJ6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MED4Q9NPJ6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MED4Q9NPJ6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MED4Q9NPJ6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MED4Q9NPJ6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MED4Q9NPJ6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MED4Q9NPJ6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MED4Q9NPJ6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MED4Q9NPJ6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MED4Q9NPJ6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MED4Q9NPJ6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MED4Q9NPJ6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MED4Q9NPJ6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MED4Q9NPJ6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MED4Q9NPJ6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MED4Q9NPJ6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MED4Q9NPJ6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MED4Q9NPJ6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MED4Q9NPJ6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MED4Q9NPJ6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MED4Q9NPJ6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MED4Q9NPJ6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MED4Q9NPJ6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MED4Q9NPJ6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MED4Q9NPJ6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MED4Q9NPJ6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MED4Q9NPJ6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MED4Q9NPJ6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MED4Q9NPJ6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.7 ms