Protein–RNA interactions for Protein: Q9H790

EXO5, Exonuclease V, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXO5Q9H790 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXO5Q9H790 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXO5Q9H790 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXO5Q9H790 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXO5Q9H790 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXO5Q9H790 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXO5Q9H790 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXO5Q9H790 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXO5Q9H790 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXO5Q9H790 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXO5Q9H790 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXO5Q9H790 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXO5Q9H790 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXO5Q9H790 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EXO5Q9H790 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXO5Q9H790 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXO5Q9H790 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXO5Q9H790 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXO5Q9H790 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXO5Q9H790 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXO5Q9H790 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXO5Q9H790 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXO5Q9H790 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXO5Q9H790 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXO5Q9H790 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXO5Q9H790 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXO5Q9H790 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXO5Q9H790 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EXO5Q9H790 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXO5Q9H790 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXO5Q9H790 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXO5Q9H790 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXO5Q9H790 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXO5Q9H790 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXO5Q9H790 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXO5Q9H790 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXO5Q9H790 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXO5Q9H790 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
EXO5Q9H790 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXO5Q9H790 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXO5Q9H790 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXO5Q9H790 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXO5Q9H790 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXO5Q9H790 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXO5Q9H790 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXO5Q9H790 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXO5Q9H790 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXO5Q9H790 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXO5Q9H790 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXO5Q9H790 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXO5Q9H790 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXO5Q9H790 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXO5Q9H790 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXO5Q9H790 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXO5Q9H790 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXO5Q9H790 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXO5Q9H790 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXO5Q9H790 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXO5Q9H790 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXO5Q9H790 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXO5Q9H790 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXO5Q9H790 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXO5Q9H790 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXO5Q9H790 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXO5Q9H790 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXO5Q9H790 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXO5Q9H790 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXO5Q9H790 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EXO5Q9H790 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXO5Q9H790 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXO5Q9H790 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXO5Q9H790 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXO5Q9H790 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EXO5Q9H790 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EXO5Q9H790 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXO5Q9H790 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXO5Q9H790 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXO5Q9H790 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXO5Q9H790 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXO5Q9H790 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXO5Q9H790 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXO5Q9H790 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXO5Q9H790 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXO5Q9H790 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXO5Q9H790 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXO5Q9H790 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EXO5Q9H790 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXO5Q9H790 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXO5Q9H790 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXO5Q9H790 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXO5Q9H790 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXO5Q9H790 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXO5Q9H790 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXO5Q9H790 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EXO5Q9H790 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXO5Q9H790 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXO5Q9H790 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXO5Q9H790 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXO5Q9H790 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXO5Q9H790 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms