Protein–RNA interactions for Protein: Q9H788

SH2D4A, SH2 domain-containing protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D4AQ9H788 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SH2D4AQ9H788 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SH2D4AQ9H788 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SH2D4AQ9H788 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SH2D4AQ9H788 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SH2D4AQ9H788 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
SH2D4AQ9H788 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SH2D4AQ9H788 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SH2D4AQ9H788 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SH2D4AQ9H788 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SH2D4AQ9H788 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SH2D4AQ9H788 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SH2D4AQ9H788 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SH2D4AQ9H788 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SH2D4AQ9H788 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SH2D4AQ9H788 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SH2D4AQ9H788 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SH2D4AQ9H788 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SH2D4AQ9H788 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SH2D4AQ9H788 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SH2D4AQ9H788 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SH2D4AQ9H788 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SH2D4AQ9H788 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SH2D4AQ9H788 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
SH2D4AQ9H788 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SH2D4AQ9H788 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SH2D4AQ9H788 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SH2D4AQ9H788 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
SH2D4AQ9H788 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SH2D4AQ9H788 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SH2D4AQ9H788 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SH2D4AQ9H788 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SH2D4AQ9H788 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SH2D4AQ9H788 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SH2D4AQ9H788 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SH2D4AQ9H788 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SH2D4AQ9H788 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SH2D4AQ9H788 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SH2D4AQ9H788 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SH2D4AQ9H788 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SH2D4AQ9H788 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SH2D4AQ9H788 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SH2D4AQ9H788 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SH2D4AQ9H788 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SH2D4AQ9H788 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SH2D4AQ9H788 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SH2D4AQ9H788 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SH2D4AQ9H788 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SH2D4AQ9H788 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SH2D4AQ9H788 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SH2D4AQ9H788 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SH2D4AQ9H788 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SH2D4AQ9H788 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SH2D4AQ9H788 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SH2D4AQ9H788 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SH2D4AQ9H788 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SH2D4AQ9H788 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SH2D4AQ9H788 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SH2D4AQ9H788 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SH2D4AQ9H788 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SH2D4AQ9H788 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SH2D4AQ9H788 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
SH2D4AQ9H788 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SH2D4AQ9H788 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SH2D4AQ9H788 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SH2D4AQ9H788 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SH2D4AQ9H788 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SH2D4AQ9H788 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SH2D4AQ9H788 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SH2D4AQ9H788 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SH2D4AQ9H788 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SH2D4AQ9H788 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SH2D4AQ9H788 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SH2D4AQ9H788 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SH2D4AQ9H788 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SH2D4AQ9H788 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SH2D4AQ9H788 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SH2D4AQ9H788 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SH2D4AQ9H788 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SH2D4AQ9H788 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SH2D4AQ9H788 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SH2D4AQ9H788 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SH2D4AQ9H788 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SH2D4AQ9H788 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SH2D4AQ9H788 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SH2D4AQ9H788 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SH2D4AQ9H788 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SH2D4AQ9H788 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SH2D4AQ9H788 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SH2D4AQ9H788 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SH2D4AQ9H788 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SH2D4AQ9H788 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SH2D4AQ9H788 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SH2D4AQ9H788 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SH2D4AQ9H788 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SH2D4AQ9H788 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SH2D4AQ9H788 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SH2D4AQ9H788 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SH2D4AQ9H788 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SH2D4AQ9H788 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms