Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D3

XKR8, XK-related protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR8Q9H6D3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
XKR8Q9H6D3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
XKR8Q9H6D3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
XKR8Q9H6D3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
XKR8Q9H6D3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
XKR8Q9H6D3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
XKR8Q9H6D3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
XKR8Q9H6D3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
XKR8Q9H6D3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
XKR8Q9H6D3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
XKR8Q9H6D3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
XKR8Q9H6D3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
XKR8Q9H6D3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
XKR8Q9H6D3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
XKR8Q9H6D3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
XKR8Q9H6D3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
XKR8Q9H6D3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XKR8Q9H6D3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
XKR8Q9H6D3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
XKR8Q9H6D3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XKR8Q9H6D3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
XKR8Q9H6D3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
XKR8Q9H6D3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XKR8Q9H6D3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
XKR8Q9H6D3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
XKR8Q9H6D3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XKR8Q9H6D3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XKR8Q9H6D3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XKR8Q9H6D3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XKR8Q9H6D3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
XKR8Q9H6D3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XKR8Q9H6D3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
XKR8Q9H6D3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XKR8Q9H6D3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XKR8Q9H6D3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
XKR8Q9H6D3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
XKR8Q9H6D3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XKR8Q9H6D3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XKR8Q9H6D3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
XKR8Q9H6D3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
XKR8Q9H6D3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
XKR8Q9H6D3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
XKR8Q9H6D3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
XKR8Q9H6D3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XKR8Q9H6D3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XKR8Q9H6D3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
XKR8Q9H6D3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
XKR8Q9H6D3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
XKR8Q9H6D3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
XKR8Q9H6D3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
XKR8Q9H6D3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
XKR8Q9H6D3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
XKR8Q9H6D3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XKR8Q9H6D3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XKR8Q9H6D3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XKR8Q9H6D3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
XKR8Q9H6D3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
XKR8Q9H6D3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XKR8Q9H6D3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
XKR8Q9H6D3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
XKR8Q9H6D3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
XKR8Q9H6D3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
XKR8Q9H6D3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
XKR8Q9H6D3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
XKR8Q9H6D3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
XKR8Q9H6D3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
XKR8Q9H6D3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
XKR8Q9H6D3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
XKR8Q9H6D3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
XKR8Q9H6D3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
XKR8Q9H6D3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
XKR8Q9H6D3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
XKR8Q9H6D3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
XKR8Q9H6D3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
XKR8Q9H6D3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
XKR8Q9H6D3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
XKR8Q9H6D3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
XKR8Q9H6D3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
XKR8Q9H6D3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
XKR8Q9H6D3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
XKR8Q9H6D3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
XKR8Q9H6D3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XKR8Q9H6D3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XKR8Q9H6D3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XKR8Q9H6D3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XKR8Q9H6D3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
XKR8Q9H6D3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XKR8Q9H6D3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XKR8Q9H6D3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XKR8Q9H6D3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XKR8Q9H6D3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XKR8Q9H6D3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
XKR8Q9H6D3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XKR8Q9H6D3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XKR8Q9H6D3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
XKR8Q9H6D3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
XKR8Q9H6D3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
XKR8Q9H6D3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
XKR8Q9H6D3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XKR8Q9H6D3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms